免费论文查重与付费论文查重在服务内容、准确度和隐私保护方面存在明显区别。免费论文查重通常提供简单的查重功能，准确度较低，而且可能存在信息泄露的风险。付费论文查重服务通常提供更全面的检测报告和更可靠的隐私保护，准确度较高。建议根据自身需求和论文重要性选择合适的查重方式。

免费论文查重通常是通过一些免费的在线工具进行，这些工具可能只能检测出一些表面的相似度，无法深入分析论文的原创性和学术价值。而付费论文查重服务通常由专业的机构提供，能够提供更全面的检测报告，包括详细的相似度分析和原创性评价。因此，对于重要的学术论文，建议选择付费的专业查重服务，以确保论文的原创性和学术价值。